В первые месяцы войны добровольно ушли на фронт 80 сотрудников академии. Полк, сформированный из слушателей и постоянного состава академии, в 1941 г. работал на оборонительных сооружениях под Москвой и там же занимал оборонительные позиции. Находясь в тылу, весь коллектив академии в своей повседневной работе ощущал неразрывную связь с фронтом, вносил свой вклад в общее дело разгрома врага. В 1943 г. личный состав академии внес в фонд обороны СССР денежные средства на сумму 720 000 руб., за что получил благодарность И. Сталина. Текст телеграммы гласил: «Самарканд. Военно-ветеринарной академии. Товарищам Петуховскому, Полякову, Руденко. Передайте начальствующему, профессорско-преподавательскому составу и слушателям Военно-ветеринарной академии, собравшим 720 000 рублей в фонд обороны Союза ССР, мой боевой привет и благодарность Красной Армии. И. Сталин».
В 1943 году Московский зооветеринарный институт возвратился в Москву и разместился в Черемушках на базе Всесоюзного научно-исследовательского института животноводства, а также в 1944 году институту был представлен 12 корпус Тимирязевской сельскохозяйственной академии.
На начало 1941 года в стране работали 11 тыс. ветврачей и более 113 тыс. ветфельдшеров. Из запаса, за период войны, было призвано в армию 6507 ветврачей и 10 290 ветфельдшеров.
Необходимость использования лошадей и других войсковых животных диктовалась острой нехваткой моторных средств, невозможностью использования ввиду сложных погодных условий автомобильного и других видов транспорта. Лошади применялись во всех боевых операциях и службах тыла. К сентябрю 1941 года численность лошадей в армии составляла 1324676, а в отдельные периоды войны – до 2 млн.
Кавалерия имела неоспоримое преимущество в маневренности и проходимости. Перед началом войны в составе Красной армии было 9 кавалерийских и 2 горно-кавалерийские дивизии. К декабрю 1941 года в ходе операции под Москвой их насчитывалось 22, а к лету 1943 г. – 27.
В битве под Сталинградом работали 209 гужевых транспортных рот численностью лошадей более 30 тыс., а также отдельные гужевые роты на верблюдах и волах.
Кроме лошадей, на ветеринарном обеспечении и обслуживании находились крупный и мелкий рогатый скот продовольственных гуртов, тысячи военных собак, животные подсобных хозяйств войсковых частей военных округов, а также животные, брошенные населением, эвакуированным из районов боевых действий.
